网站开发费的小规税率主要取决于纳税人类型（小规模纳税人或一般纳税人）以及具体的服务内容。以下是设计税率一些可能的税率信息：

增值税

小规模纳税人税率为3%。

一般纳税人税率为6%。费税发费

城建税、率网教育费附加和地方教育费附加

城建税：增值税、站开营业税、小规消费税纳税额 * 适用税率（市区7%，设计税率县城、费税发费镇、率网大中型工矿企业不在市区、站开镇的小规5%，不在市区、设计税率县城、费税发费镇的率网1%）。

教育费附加：增值税、站开营业税、消费税纳税额 * 3%。

地方教育费附加：增值税、营业税、消费税纳税额 * 2%。

综合以上信息，如果网站制作公司是一般纳税人，开具发票的综合税率大约是4.7%。

建议

一般纳税人：建议按照6%的增值税税率开具发票，并考虑城建税、教育费附加和地方教育费附加。

小规模纳税人：建议按照3%的增值税税率开具发票，并考虑城建税、教育费附加和地方教育费附加。

请注意，税率可能会因地区和具体政策有所不同，建议在实际操作中咨询当地税务部门或专业会计师以获取最准确的税率信息。