基于 GPS 开源仓库(Bin Chen Lab, Cell 2026)。GPS 全称为 Gene expression profile Predictor on chemical Structures,用于从分子结构预测基因表达扰动,并支持基于转录逆转的药物重定向与化合物筛选。
1. 平台概览
GPS 代码由三部分组成:
| 模块 | 目录 | 作用 |
|---|---|---|
| RCL | RCL/ |
在 LINCS 扰动数据上训练抗噪 MLP |
| GPS4Drugs | GPS4Drugs/ |
对新化合物预测 profile,并用 RGES 做逆转评分 |
| MolSearch | MolSearch/ |
以 RGES 等为奖励的 MCTS 分子优化(可选) |
典型药物重定向流程:
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