利用openslide-python处理病理

最新推荐文章于 2026-05-02 09:07:00 发布

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博客总结https://www.jianshu.com/p/bd5b572b5269

官方文档：https://openslide.org/api/python/#module-openslide

获取元信息，如每个像素有多少微米

import openslide

wsi = openslide.Openslide(wsi_file)
mpp_x = wsi_ob.properties[openslide.PROPERTY_NAME_MPP_X]
mpp_y = wsi_ob.properties[openslide.PROPERTY_NAME_MPP_Y]

In [8]: from openslide import OpenSlide

# 读入一个WSI图像，生成一个slide实例
In [9]: slide = OpenSlide('tumor_001.tif')

# 原始图像经各个level水平缩放后的长和宽
In [10]: slide.level_dimensions
Out[10]:
((97792, 221184),
 (48896, 110592),
 (24448, 55296),
 (12224, 27648),
 (6112, 13824),
 (3056, 6912),
 (1528, 3456),
 (764, 1728),
 (382, 864),
 (191, 432))

# 在医学影像处理中，常见的是将图像进行level8水平的缩放
In [11]: slide.level_dimensions[8]
Out[11