Idi na sadržaj

ITPKA

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
ITPKA
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1W2C, 1W2D, 1W2F, 4UPU

Identifikatori
AliasiITPKA
Vanjski ID-jeviOMIM: 147521 MGI: 1333822 HomoloGene: 1671 GeneCards: ITPKA
EC broj2.7.1.127
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za ITPKA
Genomska lokacija za ITPKA
Bend15q15.1Početak41,493,393 bp[1]
Kraj41,503,551 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za ITPKA
Genomska lokacija za ITPKA
Bend2|2 E5Početak119,572,818 bp[2]
Kraj119,581,744 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija• calmodulin-dependent protein kinase activity
• aktivnost sa transferazom
• nucleotide binding
• inositol-1,4,5-trisphosphate 3-kinase activity
• ATP binding
• calmodulin binding
• kinase activity
Ćelijska komponenta• citosol
• dendritična kičma
Biološki proces• dendritic spine maintenance
• protein phosphorylation
• inositol phosphate metabolic process
• positive regulation of dendritic spine morphogenesis
• actin cytoskeleton organization
• inositol metabolic process
• Fosforilacija
• GO:0072468 Transdukcija signala
• regulation of synaptic plasticity
• inositol phosphate biosynthetic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_002220

NM_146125

RefSeq (bjelančevina)

NP_002211

NP_666237

Lokacija (UCSC)Chr 15: 41.49 – 41.5 MbChr 2: 119.57 – 119.58 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Inozitol-trisfosfat 3-kinaza A jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom ITPKA.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 461 aminokiselina, a molekulska težina 51.009 Da.[8].

1020304050
MTLPGGPTGMARPGGARPCSPGLERAPRRSVGELRLLFEARCAAVAAAAA
AGEPRARGAKRRGGQVPNGLPRAPPAPVIPQLTVTAEEPDVPPTSPGPPE
RERDCLPAAGSSHLQQPRRLSTSSVSSTGSSSLLEDSEDDLLSDSESRSR
GNVQLEAGEDVGQKNHWQKIRTMVNLPVISPFKKRYAWVQLAGHTGSFKA
AGTSGLILKRCSEPERYCLARLMADALRGCVPAFHGVVERDGESYLQLQD
LLDGFDGPCVLDCKMGVRTYLEEELTKARERPKLRKDMYKKMLAVDPEAP
TEEEHAQRAVTKPRYMQWREGISSSTTLGFRIEGIKKADGSCSTDFKTTR
SREQVLRVFEEFVQGDEEVLRRYLNRLQQIRDTLEVSEFFRRHEVIGSSL
LFVHDHCHRAGVWLIDFGKTTPLPDGQILDHRRPWEEGNREDGYLLGLDN
LIGILASLAER
Simboli

Struktura

[uredi | uredi izvor]

ITPKA je jedan od tri gena inozitol-trisfosfat 3-kinaze (ITP3K) kod ljudi. ITP3K proteini reguliraju metabolizam inozitol-fosfata, fosforilacijom drugog prenosnika inozitol 1,4,5-trisfosfata, dajući Ins (1,3 , 4,5) P4, što se ponekad skraćuje kao IP4. Strukturno, ITPKA pripada porodici inozitol-polifosfat kinaza (IPK). Aktivnost inozitol 1,4,5-trisfosfat 3-kinaze odgovorna je za regulaciju nivoa velikog broja inozitol-polifosfata, koji su važni u ćelijskoj signalizaciji, ponajviše inozitol-trifosfat, koji je jedini enzimska podloga. I mehanizmi fosforilacije kalcija/ kalmodulina i proteina kontroliraju njegovu aktivnost. Takođe je supstrat za cikličnu protein-kinazu koja zavisi od AMP, Ca2 + / protein-kinaza ovisna od kalcija kalmodulina i protein-kinaza C in vitro. ITPKA i ITPKB su 68% identični u C-terminalnoj regiji. Amino-terminalni region ITPKA veže filamentni aktin. Ovo svojstvo lokalizira ITPKA na dendritsku kičmu u glavnim neuronima.[9][10][11] ITPKA se fiziološki eksprimira u neuronima, ali ponekad i u ćelijama karcinoma i može doprinijeti procesima metastaziranja.[12]

Fiziološka funkcija

[uredi | uredi izvor]

ITPKA učestvuje u procesima učenja i pamćenja u neuronima.[13][14]

Uloge u ljudskim bolestima

[uredi | uredi izvor]

Iako se ITPKA fiziološki eksprimira u neuronima i sjemenicima, ponekad se izražava i u ćelijama karcinoma, a ekspresija čini karcinom agresivnijim.[12][15]

Odnos sa F-traktinom

[uredi | uredi izvor]

F-traktin obuhvata pacovske ITPKA aminokiseline 9-52. Kasnije je utvrđeno da su aminokiseline 9-40 dovoljne za vezivanje nitastih aktina.[16][17] Kada se stopi sa reporterom, kao što je zeleni fluorescentni protein, koristan je za vizualizaciju dinamike aktina u živim ćelijama.[18][19]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137825 - Ensembl, maj 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027296 - Ensembl, maj 2017
  3. ↑ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ↑ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ↑ Erneux C, Roeckel N, Takazawa K, Mailleux P, Vassart G, Mattei MG (oktobar 1992). "Localization of the genes for human inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A (ITPKA) and B (ITPKB) to chromosome regions 15q14-q21 and 1q41-q43, respectively, by in situ hybridization". Genomics. 14 (2): 546–7. doi:10.1016/S0888-7543(05)80265-4. PMID 1330886.
  6. ↑ Takazawa K, Perret J, Dumont JE, Erneux C (decembar 1990). "Human brain inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase cDNA sequence". Nucleic Acids Research. 18 (23): 7141. doi:10.1093/nar/18.23.7141. PMC 332787. PMID 2175886.
  7. ↑ name="entrez""Entrez Gene: ITPKA inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A". Arhivirano s originala, 25. 10. 2018. Pristupljeno 15. 7. 2021.
  8. ↑ "UniProt, P23677". Pristupljeno 15. 7. 2021.
  9. ↑ Yamada M, Kakita A, Mizuguchi M, Rhee SG, Kim SU, Ikuta F (mart 1993). "Specific expression of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase in dendritic spines". Brain Research. 606 (2): 335–40. doi:10.1016/0006-8993(93)91004-C. PMID 8387863.
  10. ↑ Schell MJ, Erneux C, Irvine RF (oktobar 2001). "Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A associates with F-actin and dendritic spines via its N terminus". The Journal of Biological Chemistry. 276 (40): 37537–46. doi:10.1074/jbc.M104101200. PMID 11468283.
  11. ↑ Windhorst S, Minge D, Bähring R, Hüser S, Schob C, Blechner C, Lin HY, Mayr GW, Kindler S (mart 2012). "Inositol-1,4,5-trisphosphate 3-kinase A regulates dendritic morphology and shapes synaptic Ca2+ transients". Cellular Signalling. 24 (3): 750–7. doi:10.1016/j.cellsig.2011.11.010. PMID 22120525.
  12. 1 2 Windhorst S, Fliegert R, Blechner C, Möllmann K, Hosseini Z, Günther T, Eiben M, Chang L, Lin HY, Fanick W, Schumacher U, Brandt B, Mayr GW (februar 2010). "Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase-A is a new cell motility-promoting protein that increases the metastatic potential of tumor cells by two functional activities". The Journal of Biological Chemistry. 285 (8): 5541–54. doi:10.1074/jbc.M109.047050. PMC 2820782. PMID 20022963.
  13. ↑ Chung S, Kim IH, Lee D, Park K, Kim JY, Lee YK, Kim EJ, Lee HW, Choi JS, Son GH, Sun W, Shin KS, Kim H (april 2016). "The role of inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A in regulating emotional behavior and amygdala function". Scientific Reports. 6: 23757. doi:10.1038/srep23757. PMC 4823716. PMID 27053114.
  14. ↑ Choi B, Lee HW, Mo S, Kim JY, Kim HW, Rhyu IJ, Hong E, Lee YK, Choi JS, Kim CH, Kim H (2018). "Inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A overexpressed in mouse forebrain modulates synaptic transmission and mGluR-LTD of CA1 pyramidal neurons". PLOS One. 13 (4): e0193859. doi:10.1371/journal.pone.0193859. PMC 5884490. PMID 29617377.
  15. ↑ Windhorst S, Song K, Gazdar AF (august 2017). "Inositol-1,4,5-trisphosphate 3-kinase-A (ITPKA) is frequently over-expressed and functions as an oncogene in several tumor types". Biochemical Pharmacology. 137: 1–9. doi:10.1016/j.bcp.2017.03.023. PMC 5555585. PMID 28377279.
  16. ↑ Johnson HW, Schell MJ (decembar 2009). "Neuronal IP3 3-kinase is an F-actin-bundling protein: role in dendritic targeting and regulation of spine morphology". Molecular Biology of the Cell. 20 (24): 5166–80. doi:10.1091/mbc.E09-01-0083. PMC 2793293. PMID 19846664.
  17. ↑ Yi J, Wu XS, Crites T, Hammer JA (mart 2012). "Actin retrograde flow and actomyosin II arc contraction drive receptor cluster dynamics at the immunological synapse in Jurkat T cells". Molecular Biology of the Cell. 23 (5): 834–52. doi:10.1091/mbc.E11-08-0731. PMC 3290643. PMID 22219382.
  18. ↑ Belin BJ, Goins LM, Mullins RD (2014). "Comparative analysis of tools for live cell imaging of actin network architecture". Bioarchitecture. 4 (6): 189–202. doi:10.1080/19490992.2014.1047714. PMC 4914014. PMID 26317264.
  19. ↑ Melak M, Plessner M, Grosse R (februar 2017). "Actin visualization at a glance". Journal of Cell Science. 130 (3): 525–530. doi:10.1242/jcs.189068. PMID 28082420.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]