Pseudomonadati
Pseudomonadati, anteriormente Gracilicutes o Hydrobacteria es un reino de bacterias gramnegativas que presenta gran respaldo en los estudios filogenéticos y que está conformado por los grupos Pseudomonadota, Spirochaetota, PVC, FCB y otros filos.[1]
Fue inicialmente creado como taxón en 1978 por Gibbons y Murray,[2] editores del Manual de Bergey, para agrupar a las bacterias gram negativas poseedoras de una delgada pared celular, nombrado Gracilicutes proviene de cutes = piel y gracilis = delgado, en alusión a esta delgada pared de mureína. El término Hydrobacteria alude a que este grupo habría evolucionado en el océano, en contraposición a otro supergrupo, Terrabacteria o Bacillati, que evolucionó en hábitat terrestres. En 2024 el grupo fue nombrado Pseudomonadati otorgándole rango de reino.
Características
[editar]- La pared celular es típicamente delgada y en ciertos casos se ha perdido.
- Son bacterias gramnegativas debido a que la pared de peptidoglicano no es externa.
- Son didérmicas, es decir, presentan dos membranas celulares , la interna o citoplasmática y la externa que envuelve a la pared bacteriana.
- A diferencia de otras bacterias didérmicas, la membrana externa presenta moléculas grandes y complejas de lipopolisacáridos, cuya porción lipídica actúa como una endotoxina.
- Predominantemente son acuáticas o de medios húmedos.
- Son flagelados, el flagelo bacteriano se inserta en la pared y membranas celulares.
- Son mesófilos o psicrófilos (no son termófilos, salvo pocas excepciones).
- El metabolismo es muy versátil y variado.
- Presencia del inserto proteico Hsp60.
En realidad, todas estas características se presentan también en el filo Cyanobacteriota, por lo que podría haber alguna relación evolutiva, y de acuerdo con R. Gupta formarían un clado, aunque esto no ha sido respaldado dado que las cianobacterias forman parte de Bacillati.[3]
Fusobacteriota estaría estrechamente emparentado con el reino Pseudomonadati de acuerdo con la filogenia concatenada de los ARN ribosómicos 16S y 23S,[4] así como lo obtenido con análisis genómicos recientes (2019).[5]
Filogenia
[editar]Dentro de la filogenia bacteriana, Pseudomonadati está bien respaldado como un superclado por numerosos estudios basados en el ARNr 16S, 23S, proteínas, enzimas, secuencias de genes, citología y microbiología evolutiva.
Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:[6][7]
| Bacteria |
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Otros análisis filogenéticos especialmente de Cavalier-Smith (2020) han sugerido que Planctobacteria (grupo PVC) es el grupo hermano de Neomura, el clado que incluye a las arqueas y eucariotas, lo que haría que Pseudomonadati sea un taxón parafilético de Neomura. Sin embargo está filogenia no es respaldada por la mayoría de los estudios.[8][9]
| Cytota |
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Referencias
[editar]- ↑ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 de enero de 2024). «Valid publication of names of two domains and seven kingdoms of prokaryotes». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 74 (1). doi:10.1099/ijsem.0.006242.
- ↑ Gibbons, N. E. & Murray, R. G. E. 1978. Proposals concerning the higher taxa of bacteria. Int J Syst Bacteriol 28:1–6, (PDF)
- ↑ Gupta RS 2011, Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes. Antonie Van Leeuwenhoek. 2011 Aug;100(2):171-82. doi: 10.1007/s10482-011-9616-8. Epub 2011 Jun 30.
- ↑ Cheryl P. Andam & J. Peter Gogarten 2011. Biased gene transfer in microbial evolution. Figure 1 --| Phylogenetic analysis of bacterial tyrosyl-tRNA synthetase amino acid sequences and the corresponding concatenated 16S–23S ribosomal RNA phylogeny. Nature Reviews Microbiology 9, 543-555 doi:10.1038/nrmicro2593
- ↑ Zhu, Q., Mai, U., Pfeiffer, W. et al. (2019) «Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea». Nature Communications, 10: 5477
- ↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021. Consultado el 21 de julio de 2021.
- ↑ «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.
- ↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma 257 (3): 621-753. PMC 7203096. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7.
- ↑ Tom A Williams, Sarah E Heaps, Svetlana Cherlin, Tom MW Nye, Richard J Boys, T Martin Emble (2015). «New substitution models for rooting phylogenetic trees». Royal Society 257 (3): 621-753. PMC 4571574. PMID 26323766. doi:10.1098/rstb.2014.0336.
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