ISG20

ISG20
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WLJ
Ідентифікатори
Символи	ISG20, CD25, HEM45, interferon stimulated exonuclease gene 20kDa, interferon stimulated exonuclease gene 20
Зовнішні ІД	OMIM: 604533 MGI: 1928895 HomoloGene: 31081 GeneCards: ISG20
шифр КФ	3.1.13.1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• 3'-5'-exoribonuclease activity; • single-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity; • exoribonuclease II activity; • зв’язування з іоном металу; • U3 snoRNA binding; • U2 snRNA binding; • зв'язування з РНК; • зв'язування з нуклеїновими кислотами; • U1 snRNA binding; • nuclease activity; • exonuclease activity; • гідролазна активність;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Тільце Кахаля; • PML body; • нуклеоплазма; • ядерце; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• процес імунної системи; • response to virus; • Деградація РНК; • negative regulation of viral genome replication; • DNA catabolic process, exonucleolytic; • defense response to virus; • type I interferon signaling pathway; • rRNA processing; • вроджений імунітет; • проліферація; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3669
	57444
	ENSG00000172183
	ENSMUSG00000039236
	Q96AZ6
	Q9JL16
NM_001303233; NM_001303234; NM_001303235; NM_001303236; NM_001303237;
	NM_002201
	NM_001113527; NM_001291220; NM_001291221; NM_020583
NP_001290162; NP_001290163; NP_001290164; NP_001290165; NP_001290166;
	NP_002192
	NP_001106999; NP_001278149; NP_001278150; NP_065608
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ISG20 (англ. Interferon stimulated exonuclease gene 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 181 амінокислот, а молекулярна маса — 20 363^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGSREVVAM	DCEMVGLGPH	RESGLARCSL	VNVHGAVLYD	KFIRPEGEIT
DYRTRVSGVT	PQHMVGATPF	AVARLEILQL	LKGKLVVGHD	LKHDFQALKE
DMSGYTIYDT	STDRLLWREA	KLDHCRRVSL	RVLSERLLHK	SIQNSLLGHS
SVEDARATME	LYQISQRIRA	RRGLPRLAVS	D

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, процесинг рРНК, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Pentecost B.T. (1998). Expression and estrogen regulation of the HEM45 mRNA in human tumor lines and in the rat uterus. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 64: 25—33. PMID 9569007 doi:10.1016/S0960-0760(97)00140-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Nguyen L.H., Espert L., Mechti N., Wilson D.M. III (2001). The human interferon- and estrogen-regulated ISG20/HEM45 gene product degrades single-stranded RNA and DNA in vitro. Biochemistry. 40: 7174—7179. PMID 11401564 doi:10.1021/bi010141t
Degols G., Eldin P., Mechti N. (2007). ISG20, an actor of the innate immune response. Biochimie. 89: 831—835. PMID 17445960 doi:10.1016/j.biochi.2007.03.006

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6130 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96AZ6 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.