MTCL1

MTCL1
Ідентифікатори
Символи	MTCL1, CCDC165, KIAA0802, SOGA2, microtubule crosslinking factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615766 MGI: 1915867 HomoloGene: 41017 GeneCards: MTCL1
Онтологія гена Молекулярна функція • гомодимеризація білків • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • microtubule binding • зв'язування з РНК Клітинна компонента • apical plasma membrane • клітинна мембрана • мембрана • цитоплазма • midbody • полюс веретена поділу • цитоскелет • lateral plasma membrane • міжклітинний простір • apicolateral plasma membrane • microtubule bundle Біологічний процес • regulation of autophagy • microtubule bundle formation • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • positive regulation of protein targeting to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23255	68617
Ensembl	ENSG00000168502	ENSMUSG00000052105
UniProt	Q9Y4B5	Q3UHU5
RefSeq (мРНК)	NM_015210	NM_001114098 NM_172963
RefSeq (білок)	NP_056025 NP_001365134 NP_001365135 NP_001365136	NP_001107570 NP_766551
Локус (UCSC)	Хр. 18: 8.71 – 8.83 Mb	Хр. 17: 66.64 – 66.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MTCL1 (англ. Microtubule crosslinking factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 905 амінокислот, а молекулярна маса — 209 526.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METLNGPAGG		GAPDAKLQPP		GQHHRHHHLH		PVAERRRLHR		APSPARPFLK
DLHARPAAPG		PAVPSSGRAP		APAAPRSPNL		AGKAPPSPGS		LAAPGRLSRR
SGGVPGAKDK		PPPGAGARAA		GGAKAALGSR		RAARVAPAEP		LSRAGKPPGA
EPPSAAAKGR		KAKRGSRAPP		ARTVGPPTPA		ARIPAVTLAV		TSVAGSPARC
SRISHTDSSS		DLSDCPSEPL		SDEQRLLPAA		SSDAESGTGS		SDREPPRGAP
TPSPAARGAP		PGSPEPPALL		AAPLAAGACP		GGRSIPSGVS		GGFAGPGVAE
DVRGRSPPER		PVPGTPKEPS		LGEQSRLVPA		AEEEELLREM		EELRSENDYL
KDELDELRAE		MEEMRDSYLE		EDVYQLQELR		RELDRANKNC		RILQYRLRKA
EQKSLKVAET		GQVDGELIRS		LEQDLKVAKD		VSVRLHHELK		TVEEKRAKAE
DENETLRQQM		IEVEISKQAL		QNELERLKES		SLKRRSTREM		YKEKKTFNQD
DSADLRCQLQ		FAKEEAFLMR		KKMAKLGREK		DELEQELQKY		KSLYGDVDSP
LPTGEAGGPP		STREAELKLR		LKLVEEEANI		LGRKIVELEV		ENRGLKAEME
DMRGQQEREG		PGRDHAPSIP		TSPFGDSLES		STELRRHLQF		VEEEAELLRR
SISEIEDHNR		QLTHELSKFK		FEPPREPGWL		GEGASPGAGG		GAPLQEELKS
ARLQISELSG		KVLKLQHENH		ALLSNIQRCD		LAAHLGLRAP		SPRDSDAESD
AGKKESDGEE		SRLPQPKREG		PVGGESDSEE		MFEKTSGFGS		GKPSEASEPC
PTELLKARED		SEYLVTLKHE		AQRLERTVER		LITDTDSFLH		DAGLRGGAPL
PGPGLQGEEE		QGEGDQQEPQ		LLGTINAKMK		AFKKELQAFL		EQVNRIGDGL
SPLPHLTESS		SFLSTVTSVS		RDSPIGNLGK		ELGPDLQSRL		KEQLEWQLGP
ARGDERESLR		LRAARELHRR		ADGDTGSHGL		GGQTCFSLEM		EEEHLYALRW
KELEMHSLAL		QNTLHERTWS		DEKNLMQQEL		RSLKQNIFLF		YVKLRWLLKH
WRQGKQMEEE		GEEFTEGEHP		ETLSRLGELG		VQGGHQADGP		DHDSDRGCGF
PVGEHSPHSR		VQIGDHSLRL		QTADRGQPHK		QVVENQQLFS		AFKALLEDFR
AELREDERAR		LRLQQQYASD		KAAWDVEWAV		LKCRLEQLEE		KTENKLGELG
SSAESKGALK		KEREVHQKLL		ADSHSLVMDL		RWQIHHSEKN		WNREKVELLD
RLDRDRQEWE		RQKKEFLWRI		EQLQKENSPR		RGGSFLCDQK		DGNVRPFPHQ
GSLRMPRPVA		MWPCADADSI		PFEDRPLSKL		KESDRCSASE		NLYLDALSLD
DEPEEPPAHR		PEREFRNRLP		EEEENHKGNL		QRAVSVSSMS		EFQRLMDISP
FLPEKGLPST		SSKEDVTPPL		SPDDLKYIEE		FNKSWDYTPN		RGHNGGGPDL
WADRTEVGRA		GHEDSTEPFP		DSSWYLTTSV		TMTTDTMTSP		EHCQKQPLRS
HVLTEQSGLR		VLHSPPAVRR		VDSITAAGGE		GPFPTSRARG		SPGDTKGGPP
EPMLSRWPCT		SPRHSRDYVE		GARRPLDSPL		CTSLGFASPL		HSLEMSKNLS
DDMKEVAFSV		RNAICSGPGE		LQVKDMACQT		NGSRTMGTQT		VQTISVGLQT
EALRGSGVTS		SPHKCLTPKA		GGGATPVSSP		SRSLRSRQVA		PAIEKVQAKF
ERTCCSPKYG		SPKLQRKPLP		KADQPNNRTS		PGMAQKGYSE		SAWARSTTTR
ESPVHTTIND		GLSSLFNIID		HSPVVQDPFQ		KGLRAGSRSR		SAEPRPELGP
GQETGTNSRG		RSPSPIGVGS		EMCREEGGEG		TPVKQDLSAP		PGYTLTENVA
RILNKKLLEH		ALKEERRQAA		HGPPGLHSDS		HSLGDTAEPG		PMENQTVLLT
APWGL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 18