PHACTR1

PHACTR1
Ідентифікатори
Символи	PHACTR1, RPEL, RPEL1, dJ257A7.2, phosphatase and actin regulator 1, EIEE70, DEE70
Зовнішні ІД	OMIM: 608723 MGI: 2659021 HomoloGene: 33597 GeneCards: PHACTR1
Пов'язані генетичні захворювання
ішемічна хвороба серця, мігрень, інфаркт міокарда
Онтологія гена Молекулярна функція • protein phosphatase inhibitor activity • protein phosphatase 1 binding • зв'язування з актином • protein phosphatase regulator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • міжклітинні контакти • синапс • клітинне ядро Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • actomyosin structure organization • stress fiber assembly • cell motility • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity • regulation of phosphoprotein phosphatase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221692	218194
Ensembl	ENSG00000112137	ENSMUSG00000054728
UniProt	Q9C0D0	Q2M3X8
RefSeq (мРНК)	NM_001242648 NM_030948 NM_001322308 NM_001322309 NM_001322310 NM_001322311 NM_001322312 NM_001322313 NM_001322314 NM_001374581 NM_001374582 NM_001374583 NM_001374584	NM_001005740 NM_001005748 NM_198419 NM_001302635 NM_001302636
RefSeq (білок)	NP_001229577 NP_001309237 NP_001309238 NP_001309239 NP_001309240 NP_001309241 NP_001309242 NP_001309243 NP_112210 NP_001361510 NP_001361511 NP_001361512 NP_001361513	NP_001005740 NP_001005748 NP_001289564 NP_001289565
Локус (UCSC)	Хр. 6: 12.72 – 13.29 Mb	Хр. 13: 42.83 – 43.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PHACTR1 (англ. Phosphatase and actin regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 580 амінокислот, а молекулярна маса — 66 308.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDYPKMDYFL		DVESAHRLLD		VESAQRFFYS		QGAQARRATL		LLPPTLMAAS
SEDDIDRRPI		RRVRSKSDTP		YLAEARISFN		LGAAEEVERL		AAMRSDSLVP
GTHTPPIRRR		SKFANLGRIF		KPWKWRKKKS		EKFKHTSAAL		ERKISMRQSR
EELIKRGVLK		EIYDKDGELS		ISNEEDSLEN		GQSLSSSQLS		LPALSEMEPV
PMPRDPCSYE		VLQPSDIMDG		PDPGAPVKLP		CLPVKLSPPL		PPKKVMICMP
VGGPDLSLVS		YTAQKSGQQG		VAQHHHTVLP		SQIQHQLQYG		SHGQHLPSTT
GSLPMHPSGC		RMIDELNKTL		AMTMQRLESS		EQRVPCSTSY		HSSGLHSGDG
VTKAGPMGLP		EIRQVPTVVI		ECDDNKENVP		HESDYEDSSC		LYTREEEEEE
EDEDDDSSLY		TSSLAMKVCR		KDSLAIKLSN		RPSKRELEEK		NILPRQTDEE
RLELRQQIGT		KLTRRLSQRP		TAEELEQRNI		LKPRNEQEEQ		EEKREIKRRL
TRKLSQRPTV		EELRERKILI		RFSDYVEVAD		AQDYDRRADK		PWTRLTAADK
AAIRKELNEF		KSTEMEVHEL		SRHLTRFHRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6