XPOT

XPOT
Ідентифікатори
Символи	XPOT, XPO3, exportin for tRNA
Зовнішні ІД	OMIM: 603180 MGI: 1920442 HomoloGene: 38291 GeneCards: XPOT
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з тРНК • зв'язування з РНК Клітинна компонента • цитоплазма • ядерний матрикс • ядерна пора • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • intracellular protein transport • tRNA re-export from nucleus • tRNA export from nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11260	73192
Ensembl	ENSG00000184575	ENSMUSG00000034667
UniProt	O43592	Q9CRT8
RefSeq (мРНК)	NM_007235	NM_001081056 NM_001359618 NM_001401044 NM_001401045
RefSeq (білок)	NP_009166	NP_001074525 NP_001346547 NP_001387973 NP_001387974
Локус (UCSC)	Хр. 12: 64.4 – 64.45 Mb	Хр. 10: 121.42 – 121.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XPOT (англ. Exportin for tRNA) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 962 амінокислот, а молекулярна маса — 109 964.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEQALLGLN		PNADSDFRQR		ALAYFEQLKI		SPDAWQVCAE		ALAQRTYSDD
HVKFFCFQVL		EHQVKYKYSE		LTTVQQQLIR		ETLISWLQAQ		MLNPQPEKTF
IRNKAAQVFA		LLFVTEYLTK		WPKFFFDILS		VVDLNPRGVD		LYLRILMAID
SELVDRDVVH		TSEEARRNTL		IKDTMREQCI		PNLVESWYQI		LQNYQFTNSE
VTCQCLEVVG		AYVSWIDLSL		IANDRFINML		LGHMSIEVLR		EEACDCLFEV
VNKGMDPVDK		MKLVESLCQV		LQSAGFFSID		QEEDVDFLAR		FSKLVNGMGQ
SLIVSWSKLI		KNGDIKNAQE		ALQAIETKVA		LMLQLLIHED		DDISSNIIGF
CYDYLHILKQ		LTVLSDQQKA		NVEAIMLAVM		KKLTYDEEYN		FENEGEDEAM
FVEYRKQLKL		LLDRLAQVSP		ELLLASVRRV		FSSTLQNWQT		TRFMEVEVAI
RLLYMLAEAL		PVSHGAHFSG		DVSKASALQD		MMRTLVTSGV		SSYQHTSVTL
EFFETVVRYE		KFFTVEPQHI		PCVLMAFLDH		RGLRHSSAKV		RSRTAYLFSR
FVKSLNKQMN		PFIEDILNRI		QDLLELSPPE		NGHQSLLSSD		DQLFIYETAG
VLIVNSEYPA		ERKQALMRNL		LTPLMEKFKI		LLEKLMLAQD		EERQASLADC
LNHAVGFASR		TSKAFSNKQT		VKQCGCSEVY		LDCLQTFLPA		LSCPLQKDIL
RSGVRTFLHR		MIICLEEEVL		PFIPSASEHM		LKDCEAKDLQ		EFIPLINQIT
AKFKIQVSPF		LQQMFMPLLH		AIFEVLLRPA		EENDQSAALE		KQMLRRSYFA
FLQTVTGSGM		SEVIANQGAE		NVERVLVTVI		QGAVEYPDPI		AQKTCFIILS
KLVELWGGKD		GPVGFADFVY		KHIVPACFLA		PLKQTFDLAD		AQTVLALSEC
AVTLKTIHLK		RGPECVQYLQ		QEYLPSLQVA		PEIIQEFCQA		LQQPDAKVFK
NYLKVFFQRA		KP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Arts G.-J., Fornerod M., Mattaj I.W. (1998). Identification of a nuclear export receptor for tRNA. Curr. Biol. 8: 305—314. PMID 9512417 doi:10.1016/S0960-9822(98)70130-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Arts G.-J., Kuersten S., Romby P., Ehresmann B., Mattaj I.W. (1998). The role of exportin-t in selective nuclear export of mature tRNAs. EMBO J. 17: 7430—7441. PMID 9857198 doi:10.1093/emboj/17.24.7430
• Kuersten S., Arts G.-J., Walther T.C., Englmeier L., Mattaj I.W. (2002). Steady-state nuclear localization of exportin-t involves RanGTP binding and two distinct nuclear pore complex interaction domains. Mol. Cell. Biol. 22: 5708—5720. PMID 12138183 doi:10.1128/MCB.22.16.5708-5720.2002

Див. також

• Хромосома 12