Nel 1993, il chitarrista bianco di San Francisco Charlie Hunter (Rhode Island, 1967), ex partner musicale del rapper bianco Michael Franti e membro del suo gruppo rap-rock Disposable Heroes of Hiphoprisy (1992), formò un trio senza basso con il sassofonista tenore Dave Ellis e il batterista Jay Lane (ex membro del gruppo rock Primus), che diede inizio all'età d'oro dell'acid-jazz.
Dopo le mini-orge funky di Charlie Hunter Trio (maggio 1993), Hunter passò a una chitarra a otto corde costruita su misura (che gli permetteva di suonare ritmo e melodia contemporaneamente) e aggiunse un tocco jazz più sofisticato su Bing Bing Bing (1995).
Scott Amendola sostituì Lane prima di Ready Set Shango (1996), che aggiunse alla formazione anche il sassofonista Calder Spanier, trasformando così il trio in un quartetto. Ellis fu sostituito da Kenny Brooks degli Alphabet Soup, mentre il trombettista Chuck MacKinnon, il vibrafonista Stefon Harris e il percussionista John Santos si unirono per formare un settetto, ribattezzato Pound For Pound. Tuttavia, Hunter si sbarazzò dei fiati e ridusse la band a un quartetto chitarra, batteria, percussioni e vibrafono per Return of the Candyman (settembre 1997). Erano tutti album divertenti, apprezzati dal pubblico della disco intellettuale perché incentrati sul groove.

Trasferitosi a New York nel 1997, Hunter si dedicò sempre più alla chitarra per la sua fusion funk-soul-jazz, ma i risultati furono a dir poco mediocri: un Duo (dicembre 1998) con il batterista Leon Parker, Charlie Hunter (gennaio 2000) in sestetto con il trombonista Josh Roseman, il sassofonista tenore Peter Apfelbaum e tre percussionisti, un Solo Eight-String Guitar (maggio 2000) deludente, e Songs from the Analog Playground (2001) con la partecipazione di cantanti.
Riuscì a riscattarsi parzialmente con Right Now Move (2003), in quintetto con il trombonista Curtis Fowlkes, il sassofonista tenore John Ellis, l'armonicista Gregoire Maret e un batterista.

Come In Red Dog This is Tango Leader (febbraio 2003) è stato il primo album dei Groundtruther, un trio con il batterista Bobby Previte.
Il progetto è proseguito su Latitude (2004), con Greg Osby come terzo membro, e Longitude (settembre 2004), con DJ Logic.

Il trio di Friends Seen and Unseen (2004) ha segnato un ritorno alle origini.

Gentlemen, I Neglected To Inform You You Will Not Be Getting Paid (agosto 2009) vede Eric Kalb alla batteria, Alan Ferber e Curtis Fowlkes ai tromboni, Eric Biondo alla tromba.

Not Getting Behind Is The New Getting Ahead (maggio 2012) documenta una sessione improvvisata con il batterista Scott Amendola.

Il Charlie Hunter Trio, con Bobby Previte alle percussioni e Curtis Fowlkes al trombone, è tornato con Let The Bells Ring On (febbraio 2015).

Everybody Has A Plan Until They Get Punched In The Mouth (2017) vedeva Kirk Knuffke alla cornetta, Bobby Previte alla batteria e Curtis Fowlkes al trombone.