电商网站开发票的电商税率根据业务类型和纳税人类型有所不同，具体如下：

一、网站一般纳税人

商品销售

主流税率为 13%（2025年现行政策）；

特殊商品（如农产品）可能适用 9%税率。票税

应税服务

提供信息技术服务、电商软件服务、网站信息技术咨询等，票税通常适用 6%税率；

部分服务（如物流、电商仓储）可能适用 3%税率。网站

二、票税小规模纳税人

月销售额≤10万元

免征增值税；

若选择适用3%征收率，电商可享受减按1%征收的网站优惠政策（2020年12月前）。

月销售额>10万元

普通发票： 3%征收率；

专用发票： 3%征收率（部分地区已取消）。票税

三、电商其他注意事项

跨境电商

综合税率通常为 11.2%（2021年政策），网站具体因商品类别和交易方式而异；

部分商品可能适用零关税政策。票税

特殊行业

如租赁不动产、餐饮服务，可能适用 5%税率。

四、税率调整说明

2020年疫情期间，全国统一将小规模纳税人月销售额10万元以下免征增值税；

部分地区曾试点将3%税率降至1%，但该政策已于2021年4月15日终止。

建议根据具体业务类型和纳税人身份，结合税务机关最新政策确认适用税率。若涉及跨境业务，需进一步核实商品分类及交易性质。