「通知メール」と「アラートメール」の違い

予備知識

用語	意味
アラート	警告メッセージのこと
メール	コンピュータの世界のお手紙機能

それぞれの用語の意味

用語	意味
通知メール	何かをお知らせ（通知）するメール
アラートメール	何か警告的なものをお知らせ（通知）するメール

似ているところ

どちらも何かをお知らせ（通知）するメールです。

違うところ

お知らせする内容のニュアンスが微妙に違います。

通知メールでお知らせする内容は「何か」です。
アラートメールでお知らせする内容は「警告的な何か」です。

「アラートメール」と表現した場合の方が、少しだけ物騒（対処しないとヤバい）ニュアンスがあります。

個人的な使い分け

「気を付けて！」というニュアンスが含まれていそうだったら「アラートメール」と表現します。
含まれていなさそうだったら「通知メール」と表現します。

例えば、メールの内容が「今日の晩ご飯はカレーだよ（ただのお知らせ）」であれば通知メールです。
メールの内容が「今日の晩ご飯はカレーだよ（「だから、お昼ご飯にカレーを食べると昼夜連続でカレーになるよ。気を付けてね」という警告）」であればアラートメールと表現します。

備考

通知される内容というのは基本的に「気にしてね！」な内容なので、すべて警告的な内容と捉えることもできそうですけどね。
個人的には「通知メール」というカテゴリの中に「アラートメール」があると解釈しています。